COVID-19 : Une plateforme de ressources pour les chercheurs canadiens
Comment le projet de la plateforme de ressources sur la COVID-19 a-t-il débuté?
Dr Guillaume Bourque, professeur au département de génétique humaine de l’Université McGill et directeur de la bioinformatique au Centre de génomique de McGill. Crédit photo : McGill University Innovation and Technology
Un collègue m’a initialement contacté pour concevoir un outil en ligne qui servirait à partager de l’information sur les réactifs chimiques dans le cadre de projets de recherche sur la COVID-19. Avant de passer à l’étape de la conception, j’ai décidé de demander sur Twitter si quelqu’un travaillait déjà sur un projet similaire. C’est ainsi que je suis entré en contact avec d’autres chercheurs. Nous avons finalement décidé de travailler ensemble sur un portail qui permettrait aux chercheurs de collaborer.
Comment les gens peuvent-ils soutenir la plateforme et collaborer pour aider à combattre cette pandémie?
La plateforme est construite sur un modèle de production participative (crowdsourcing). Maintenant qu’elle est en place, les gens peuvent l’utiliser et y ajouter de l’information pour qu’elle devienne une ressource vraiment complète.
Certains de vos utilisateurs ont-ils accès à des ressources de calcul informatique de pointe (CIP)?
Des chercheurs ont effectivement accès à des ressources de CIP pour certains projets de recherche sur la COVID-19. Dans le domaine de la génomique, par exemple, nous allons séquencer à la fois les personnes infectées et le virus lui-même. Ces projets nécessitent des ressources informatiques importantes pour la phase d’analyse. La base de données de réactifs chimiques qui sera bientôt incluse dans notre plateforme sera également hébergée sur une machine virtuelle chez Calcul Québec.
De quoi avez-vous besoin pour mettre en place une base de données de ressources complète sur les efforts liés à la COVID-19 au Canada?
Nous espérons que la communauté nous aidera à consolider ce réseau afin que nous puissions éviter le chevauchement des efforts et centraliser certaines ressources.
Calcul Canada et ses partenaires régionaux, ACENET, Calcul Québec, Compute Ontario et WestGrid, mettent en lumière les efforts soutenus des chercheurs canadiens pour l’élaboration de solutions de lutte contre la pandémie de COVID-19. Si vous souhaitez accéder à des ressources en CIP, écrivez à support@calculcanada.ca.